1998-99赛季，邓肯首次入选最佳防守第一阵容并随队夺得总冠军，他场均贡献21.7分、11.4个篮板、0.9次抢断和2.5次盖帽，但最佳防守球员奖被阿隆索·莫宁获得。
1999-00赛季，虽然邓肯的数据依然十分惊人（场均23.2分12.4篮板0.9抢断2.2盖帽），但是他的防守表现还是比不上再次获得DPOY的莫宁。
2000-01赛季，邓肯率队取得了58场胜利，但场均22.2分、12.2个篮板、0.9次抢断和2.3次盖帽的表现并不足以超越那个赛季的DPOY穆。
2001-02赛季，邓肯不仅再次入选最佳防守阵容，还荣膺常规赛MVP，但DPOY奖项依然落入了本的手中。
2002-03赛季，虽然邓肯率队取得了60胜，并获得了MVP、总冠军和FMVP邓肯入选nba最佳防守阵容次数，但他的防守表现依然不足以击败大本。
2004-05赛季，邓肯继续展现出出色的防守能力，帮助球队取得59胜的战绩，夺得总冠军，但DPOY奖项还是与他无缘。
2006-07赛季邓肯入选nba最佳防守阵容次数，邓肯再次入选最佳防守阵容，并率队取得58胜，夺得总冠军，但最佳防守球员奖却被坎比获得。
2007-08赛季，邓肯职业生涯最后一次入选最佳防守阵容，虽然数据依然不错，但最佳防守球员奖却颁给了加内特。
总结一下，邓肯职业生涯多次入选最佳防守阵容，但是从来没有拿到过DPOY奖项，他在多个赛季都有出色表现邓肯入选nba最佳防守阵容次数，带领球队取得亮眼的成绩，但是这些努力从来没有换来联盟个人防守最高荣誉。